Общая структура файловой системы ОС Linux
Файловые системы Linux содержат множество каталогов, большинство из которых определяются стандартом FHS (Filesystem Hierarchy Standard).
В зависимости от используемого дистрибутива Linux, некоторых из представленных каталогов может и не быть, или наоборот, могут присуствовать другие непредставленные тут каталоги. Я попытался собрать и дать описание лишь наиболее часто встречающихся каталогов в ОС Linux.
Посмотреть структуру файловой системы можно используя команду ls -la

/ - корневой каталог
Главный каталог, в нем хранится все, что есть на вашей ОС Linux. Все разделы Linux хранятся в виде другого подкаталога в корневом каталоге /.
/bin - основные бинарные файлы (программы)
Содержит основные двоичные (бинарные) системные программы (модули), утилиты (ls, cp и т.п.) и командные оболочки (bash и т.п.), которые должны обеспечить минимальный уровень работоспособности системы в однопользовательском режиме. Размещение этих файлов в каталоге /bin гарантирует, что в системе эти важные утилиты будут даже в случае, если другие файловые системы не смонтированы.
/boot - файлы для загрузки ОС
Хранятся образы ядер Linux и файлы менеджеров загрузки (grub, lilo и т.д.).
/cdrom – точка монтирования для CD-дисков
Данный каталог не является частью стандарта FHS, содержится в Ubuntu и вышедших из него дистрибутивах. Используется как место для монтируования CD-ROM дисков.
/dev - файлы устройств
В Linux все устройства предоставлены в виде специфических файлов, расположеных в этом каталоге. Например, файл /dev/sda представляет диск SATA. Также в этом каталоге хранятся файлы псевдо-устройств (виртуальных), для этих файлов нет соответствующего реального устройства. Например, файл /dev/random генерирует случайные числа, а файл /dev/null является специальным устройством для удаления всех входных данных.
/etc - конфигурационные файлы
Содержит основные конфигурационные файлы операционной системы и различных программ.
/home - домашние каталоги пользователей
Содержит домашние каталоги пользователей. По идеологии UNIX для обеспечения безопасности ОС рекомендуется хранить пользовательские данные именно в этой директории. Например, если ваше имя пользователя mara, то у вас есть домашний каталог, который находится в /home/mara и содержит пользовательские конфигурационные файлы и личную информацию. Каждый пользователь имеет доступ на запись только в своем домашнем каталоге.
/lib - основные библиотеки
Эта директория предназначена для хранения системных библиотек и компонентов компилятора языка С, необходимых для работы программ из директорий /bin и /sbin и операционной системы в целом.
/lib64 - 64-битные основные библиотеки
Этот каталог присуствует в основном на 64-битных системах, содержит набор библиотек и компонентов компилятора языка С для 64-битных программ.
/lost+found - восстановленные файлы
Присуствует во всех ОС Linux. При сбое в работе файловой системы и дальнейшей проверке файловой системы (при загрузке ОС), все найденные поврежденные файлы будут помещены в каталоге lost+found, их можно попытаться восстановить.
/media - точка для автоматического монтирования
Используемая для автоматического монтирования различных устройств CD-ROM, USB-накопителей и т.д.
/mnt - точка для ручного монтирования
Используется для временного ручного монтирования (с помощю команды mount) различных устройств, таких как CD-ROM, USB-накопителей и т.д.
/opt - вспомогательные пакеты программ
Находятся подкаталоги для дополнительных пакетов программного обеспечения. Каталог широко используется проприетарным программным обеспечением, которое не подчиняется стандартной иерархии файловых систем.
/proc – файлы ядра и процессов
В эту директорию примонтирована виртуальная файловая система procfs. В ней находятся специальные файлы, в которых представлена информация о системе и о выполняющихся процессах. Например, в файле /proc/cpuinfo собержиться информация о процессоре.
/root - Домашний каталог пользователя root
Домашний каталог пользователя root. Вместо того, чтобы находиться в /home/root, он помещается в /root для большей надёжности системы.
/run – файлы состояния приложений
Является достаточно новым каталогом, в котором приложениям предоставляется возможность стандартным образом хранить вспомогательные файлы, которые им требуются, например, сокеты и идентификаторы процессов. Эти файлы нельзя хранить в каталоге /tmp, поскольку эти файлы могут быть там удалены.
/sbin - бинарные файлы (программы) для администрирования системы
Каталог /sbin похож на каталог /bin. В нем находятся важные двоичные файлы, которые, как правило, предназначены для их запуска пользователем при администрировании системы.
/selinux – виртуальная файловая система SELinux
В некоторых дистрибутивах (Red Hat, Fedora и т.п) для обеспечения безопасности используется пакет SELinux (Security-Enhanced Linux), при этом создается каталог с файлами /selinux.
/srv – данные сервисных служб
Этот каталог присутствует не во всех дистрибутивах, содержит "данные для сервисов, предоставляемых системой" (например, сервер Apache может хранить файлы вашего сайта в этом каталоге). В большинстве случаев директория пуста.
/sys - виртуальная файловая система sysfs
Этот каталог появился с выходом ядра версии 2.6 и в него примонтирована виртуальная файловая система sysfs с информацией об устройствах, драйверах, ядре ОС и т.п.
Описание вложеных каталогов:
/sys/block - содержит директории всех блочных устройств, присутствующих на данный момент в системе.
/sys/bus - содержит список шин, определенных в ядре Linux (eisa, pci и т.д.).
/sys/class - содержит список сгруппированных устройств по классам (printer, scsi-devices и т.д.).
/tmp - временные файлы
Временные файлы, обычно удаляются при перезагрузке системы. Является аналогом C:/Windows/Temp в ОС Windows. Все пользователи имеют права чтения и записи в этом каталоге.
/usr - пользовательские бинарные файлы, используемые только для чтения.
В этом каталоге находятся приложения и файлы, используемые только пользователями, а не самой системой.
Описание вложеных каталогов:
/usr/bin - исполняемые файлы для всех учетных записей.
/usr/games - каталог для компьютерных игр в системе.
/usr/include - файлы заголовков, предназначенные для компиляции С-программ.
/usr/lib - системные библиотеки и вспомогательные файлы, расположенные в директории /usr.
/usr/local - в этот каталог устанавливаются приложения, откомпилированные локально, что позволяет им не смешиваться с остальной частью системы.
/usr/local/bin - локальные исполняемые файлы.
/usr/local/etc - локальные системные команды и файлы конфигурации.
/usr/local/lib - локальные вспомогательные файлы.
/usr/local/sbin - локальные служебные системные команды.
/usr/local/src - исходные коды программ каталогов /usr/local/*
/usr/man - страницы интерактивной документации.
/usr/sbin - менее важные команды системного администрирования.
/usr/share - общие данные установленных программ (доступен только для чтения).
/usr/share/man - страницы интерактивной документации.
/usr/share/icons - иконки системы.
/usr/share/doc - справочная документация.
/usr/src - исходные коды нелокальных программных пакетов (например, здесь располагаются исходные кода ядра).
/var - каталог для часто меняющихся данных
В этом каталоге находятся журналы операционной системы, системные log-файлы, cache-файлы и т.д.
/var/adm - журнальные файлы, записи об инсталляции системы, административные компоненты.
/var/cache - все кэши для различных программ.
/var/games - файлы с игровыми достижениями.
/var/log - cистемные журнальные файлы (log-файлы).
/var/lock - лежат lock-файлы, указывающие на занятость некоторого ресурса.
/var/lib - изменяемые программами в процессе работы (например, базы данных, метаданные и др.).
/var/spool - буферные каталоги (например, очереди печати, непрочитанные или не отправленные письма, задачи cron и т.д.).
/var/tmp - каталог для временного хранения файлов.
/var/www - размещаются Web-страницы для сервера Apache.